Eles auxiliam o tratamento dos pacientes – como instrumento onde todas as informações coletadas são depositadas, o registro clínico serve sobretudo como base para a formação de opinião sobre o(s) problema(s) de saúde do paciente, bem como para o registro do planejamento clínico a ser implementado e o seguimento do resultado destas ações. Ele pode, ainda, ser considerado como o instrumento de comunicação entre os diferentes membros da equipe médica que tratam do paciente, bem como mecanismo de memória, visando garantir a continuidade de tratamento do paciente durante a hospitalização e entre diferentes hospitalizações ou consultas ambulatoriais, bem como possibilitando avaliar o curso das doenças ao longo da vida do paciente. Servem como base para as ações administrativas e avaliação de desempenho – o registro clínico é a fonte para realização de todos os procedimentos administrativos e financeiros, tais como cobrança das contas dos pacientes ou das instituições de saúde, avaliação do desempenho da equipe, verificação do grau de qualidade do atendimento prestado (média de dias de internação, incidência de infecção hospitalar, etc…). Servem como fonte de informações para a pesquisa médica – os estudos retrospectivos para detecção de efeitos colaterais de medicamentos, avaliação do sucesso de novas terapias, etc… só podem ser feitos com base nas informações colhidas dos pacientes.